2262年，地球军上尉伊丽莎白·洛克利被任命为巴比伦5号的指挥【ZiYuanTun.Com-资源屯】。该空间站逐渐成为从Psi军团逃跑的流氓心灵感应者的避难所，导致冲突。G'Kar，前Narn驻巴比伦5大使，在Narn Centauri战争期间被监禁时写的一本书出版后，他不情愿地成为了精神偶像。Drakh是留在银河系的阴影的前盟友，他们通过一种名为Keeper的寄生生物控制了半人马座Prime上的摄政王Virini，然后煽动半人马座和星际联盟之间的战争，以将半人马座与联盟隔离开来，并为自己获得一个可塑的家园。 Centauri Prime被Narn和Drazi战舰摧毁，Londo Mollari成为皇帝，在地球完全核毁灭的威胁下接受Drakh守护者。（在整个系列中，他的统治结束的部分内容出现在各种有先见之明的幻象中；它们显示了Mollari和前对手（后来的朋友）G'Kar在未来的十六年里死于彼此的喉咙，似乎是出于怨恨。人们逐渐发现，还有一个更友好的潜台词，莫拉里已经成为德拉赫统治的奴隶，厌倦了生活；他的Drakh守护者醒来并勒死G'Kar作为回报。Vir Cotto是Mollari忠诚且更有道德的助手，接替他成为皇帝，不受Drakh的影响。Sheridan和Delenn结婚并搬到了Minbar，以及星际联盟的总部。G'Kar离开巴比伦5号，逃离他不想要的名声，探索边缘。加里波第也结婚并定居在火星上。其他主要角色大多离开B5。 19年后，在死亡的边缘，谢里登在废弃的巴比伦5号站退役前进行了最后一次旅行。谢里登显然已经死了，但被第一人认领，他们邀请他加入他们，踏上银河系边缘之外的旅程。谢里登离开后不久，巴比伦5号站在拆除中被毁，由于联盟已经接管了其外交目的，它的存在不再必要。在最后一集里，斯特拉琴斯基客串了一个技术员，在巴比伦5号被拆除之前关灯。
